游戏滚动字幕，重新读取通关存档后，游戏剧情继续推进。
剧情后，众人离开聖地拉姆达，前往古洛塔镇南面的謎之遺跡
到达遗迹后，剧情，接着靠近雪妮娅 触发剧情
剧情后，在指示方向的裂缝墙背后，亮点处找到了「神秘の歯車」，剧情后乘坐鲸鱼，前往大樹北面的忘れられた塔。
【遗忘之塔】
在塔的入口处，调查后使用「神秘歯轮」开门进入。
一路无障碍，到达塔最上階，时之祭坛，与大白对话发生剧情，随后与卡缪对话2次，剧情中主角穿越时光，返回过去，目的拯救萝莉小红帽，改变历史。但是在这之前，先整理下主角身上的装备，将全部同班的最强武器防具都放在主角身上。
穿越时空的主角回到了过去时代，发现自己身处泽兰达山、聖地拉姆达。
前往大聖堂发生剧情后，与同伴们汇合，当然小红帽萝莉此时还依然神气活现。
这里虽然主角的等级延续没变，但是其他同伴的等级回到了之前我们到达圣地时候的等级，等级虽然低了，但是装备可以用，把之前从未来带过来的高级装备给同伴依次装备。
随后依据已经经历过的历史一样，穿过泽兰达山，前往东南方位的始祖之森。
经过始祖之森，在天空祭壇触发剧情后，到达生命大樹。
话不多说，来到生命大树前，按照之前的经历过的剧情，主角在取得勇者之剑的时候会受到偷袭，从未来归来的主人公这次并没有给偷袭者机会，偷袭未成，历史改变，剧情切入BOSS战。
有魔剑在手的主角，完全可以轻轻松松干掉眼前这个25仔BOSS荷梅洛斯 (過去)。
而发现偷袭失败的被魔王附身的国王，为了防止计划败露，直接杀人灭口干掉了荷梅洛斯，继续扮演好好国王的角色，打算伺机谋取勇者之剑。
剧情后，主人公取得「勇者之剑・真」。
【聖地狄尔卡达城】
使用传送前往狄尔卡达城镇，进入北面狄尔卡达城，到达2层玉座の間发生剧情。
剧情后，前往2階貴賓室休息，正当主角休息时，假国王出现了，打算乘着主角休息时，偷取勇者之剑，幸好被小黑怪物妨碍。
同时，假国王也被众人揭穿，众人追赶国王至玉座の間，一场BOSS战在所难免。
BOSS：魔道士巫尔诺加
本战需要一定的打法，BOSS释放紫色浓雾，会出现提示“回复效果翻转”，此时如果治愈同伴则会直接减少对方HP，如果是补充MP则反倒是减少MP。
维持几个回合，浓雾会变淡，此时可正常使用咒术、道具回复。
建议打法，群体攻击输出为主，再攻击魔王的同时，以优先打掉魔王周围的法杖为先。
具体打法可参看视频：http://www.i7gg.com/game/raider/detail?id=89082
战胜BOSS后，未成形魔王被击败，第二天在玉座の間发生剧情。
随后第8位同伴将军再次加入。
由于主角一行人干掉了魔王，历史改变，勇者星在小黑怪物的召唤下坠地，更强大的敌人出现了……
众人穿过狄尔卡达地方前往狄尔卡柯斯塔。
狄尔卡达神殿发生剧情，乘坐鲸鱼前往神民之里。
【神民之里】
这个时代由于阻止了魔王炸掉生命大树，所以众神健在。
进入深处的神苑发生剧情，随后调查长老身前的宝箱取得「最后的钥匙」
太陽の神殿内取得「神圣火种」
随后需要调查3根苗木，剧情后获得引导之木
苗木1位于度鲁达乡，直接传送过去
苗木2，乘坐鲸鱼前往邦德尔冯东北高台，调查高台的苗木
苗木3，乘坐鲸鱼前往达哈拉湿原西北高台，调查苗木。
【神民之里】
调查全部3棵苗木后返回神民之里，前往神殿与长老对话，剧情后获得「神秘歯車」
乘坐鲸鱼前往生命大樹北面的遗忘之地，使用齿轮进入遗忘之塔。
【遗忘之塔】
塔最上階，时之祭坛与大白对话，剧情后，鲸鱼觉醒，装备黄金圣衣……
前往尼尔森旅馆西面的遗迹地下，进入传送到达尼尔森的迷宫.夹缝灵道
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接下来我们可以直接去空中突入邪神领域，进入最终战，迎接真结局。
也可以调查神殿内苗木接受最多5次试炼
更可以前往之前魔王主线中的我们去过的全部城镇，依次经历由于改变历史产生影响的各城镇相关剧情。
会有不同剧情的城镇：
伊希村，与艾玛对话开启重建伊希村任务
达哈路奈镇，需要全灭城镇内的怪物
古洛塔镇，前往孤儿院，进入古洛塔地下遗迹，走到最深处触发剧情，BOSS战
狄尔卡达城内，与狄尔卡达国王对话，离开时剧情获得黄金头冠
普恰劳村，前往壁画世界内最深处，与BOSS振奋老头战斗
索尔提科镇
尤格诺尔城遗迹，前往下水道，再次见主角父亲，BOSS战
白色海湾
海底王国穆雷亚
风穴的藏匿之处
克雷莫兰
聖地拉姆达
度鲁达乡
火焰之里
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里BOSS战 邪神
成员配备：小红帽、雪妮娅、施维亚、主角勇者
输出主要依靠小红帽的全体爆炸攻击，施维亚负责解除异常状态增攻，雪妮娅负责治愈增防，主角负责扔勇者剑、治愈、辅助攻击。
见到邪神后，第一回合，操作主角时，使用道具选择「勇者之剑・真」，使用「勇者之剑・真」后，BOSS实力大减，战斗正式打响。
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